El 12 de febrero de 1832, el Coronel Ignacio Hernández, a nombre del Gobierno del Ecuador tomó posesión del Archipiélago de Galápagos. Luego de haber llegado en la goleta nacional Mercedes y recorrido el archipiélago, en la Isla Santa María, en presencia del General José Villamil, jefe de la sociedad de colonizadores y su ayudante Lorenzo Bark, del capellán Dr. Eugenio Ortiz, de algunos expedicionarios y colonos, tomó solemne posesión de todas las islas del llamado Archipiélago de Galápagos, izando el pabellón tricolor, a nombre del Gobierno del Ecuador. De inmediato "puso el nombre de Isla Floreana a la Santa María, en homenaje al fundador y primer presidente de la República, quien había enviado la expedición, dando de esta manera, favorable acogida a la iniciativa que le hiciera meses antes el General Villamil". (Jorge Villacrés Moscoso, Las Ambiciones internacionales por las Islas Galápagos) José Villamil, Gobernador de la Islas, en oficio desde la Floreana, de 29 de noviembre de 1832, escribía: "He despachado los títulos de propiedad a todos los floréanos y con este paso los veo trabajar con el mayor ahinco en cultivar una tierra que ya es suya y convertidos en propietarios y muy estimables colonos hombres que ahora seis meses eran onerosos a la sociedad por la mayor parte. Ya tiene la isla 51 casitas bien graciosas y aseadas; 48 chacras que ahora nos suministran lo necesario; y que dentro de tres meses nos darán para mantener una población de 400 almas ". Habla de que ha abierto caminos y espera llevar agua potable al puerto Hernández. (Francisco Salazar. Actas del Congreso de 1833. VI) Resolvió el Gobierno.que en cada provincia hubiera un presidio, donde los penados se reformaran, sujetos a trabajos públicos; mas a los autores de crímenes graves se los debía tener en destierro, según dictaminó el Presidente de la Alta Corte, y consultado Villamil, el Gobierno acordó remitir a la Isla Floreana a estos penados. (PRAN, 16 de marzo de 1833)